Санкт-Петербургский научный институт физической культуры был создан в январе 1933 года на базе Государственного института физического образования имени П.Ф.Лесгафта.
Изначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.).
28 июля 2022 года в Общественной палате Российской Федерации состоялся круглый стол на тему «Психологическое сопровождение детей, занимающихся физической культурой и спортом, в том числе спортом высших достижений», который состоялся в рамках деятельности Аппарата Уполномоченного при президенте Российской Федерации по правам ребенка.
28 июля 2022 года в Общественной палате Российской Федерации состоялся круглый стол на тему «Психологическое сопровождение детей, занимающихся физической культурой и спортом, в том числе спортом высших достижений», который состоялся в рамках деятельности Аппарата Уполномоченного при президенте Российской Федерации по правам ребенка.
С 8 по 10 декабря 2021 года сотрудники ФГБУ СПбНИИФК приняли участие в Конгрессе молодых ученых, направленном на вовлечение молодого поколения в научные проекты и процессы.
20 мая в конгресс-центре Центра «Космонавтики и авиации» ВДНХ, г. Москва, в смешанном формате прошел XIX Международный симпозиум памяти академика АИМ, доктора педагогических наук, профессора Виктора Даниловича Чепика «Имидж российского спорта: ответ на новые вызовы» при поддержке Министерства спорта и Министерства науки и образования РФ, Паралимпийского комитета, Сурдлимпийского комитета РФ, Комитета Государственной Думы по физической культуре, спорту, туризму и делам молодежи, Департамента спорта города Москвы.
28 апреля 2021 г. состоялось заседание Координационной группы Министерства спорта Российской Федерации по экспериментальной и инновационной деятельности в области физической культуры и спорта.
24 апреля 2021 года зав. сектором комплексных компьютерных технологий Короткова Анна Константиновна выступила на Международной научно-практической конференции «Инновационные подходы в области физической культуры и спорта» с докладом «Применение инновационных технологий в паралимпийском спорте».
26 февраля и 2 марта 2021 года в рамках выполнения государственного задания, на территории ФГБУ СПбНИИФК было проведено комплексное обследование юных лыжников-двоеборцев из СДЮСШОР «Балтийский берег» и ГБУ СШОР Выборгского района г. Санкт-Петербурга.
23 января 2021 г. в рамках действующего соглашения о сотрудничестве между ФГБУ СПбНИИФК и Ассоциацией спортивных психологов (АСП) был проведен первый онлайн семинар серии «Психологические субботники» АСП.
В соответствии с Постановлением Президиума ЦИК СССР от 27 июля 1932 года на базе Государственного института физического образования (ГИФО) им. П.Ф. Лесгафта в январе 1933 года был создан Научный институт им. П.Ф. Лесгафта, впоследствии - Ленинградский научно-исследовательский институт физической культуры (ЛНИИФК).
Первоначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.)
