Санкт-Петербургский научный институт физической культуры был создан в январе 1933 года на базе Государственного института физического образования имени П.Ф.Лесгафта.
Изначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.).
28 мая 2018 года отметил 85-летний юбилей ровесник института, старейший сотрудник СПбНИИФК, проработавший в институте 30 лет, заведующий сектором физической реабилитации и оздоровительных технологий (ФРиОТ), кандидат педагогических наук, доцент Дмитрий Николаевич Гаврилов.
В марте 1970 года сменилось руководство института: директором ЛНИИФК был назначен доктор биологических наук, професор В.А. Рогозкин, который в течение 33 лет (до июня 2003 г.) успешно руководил институтом. Ему удалось создать научный коллектив, способный решать исследовательские задачи на современном уровне.
Заместителем директора по научной работе стала кандидат педагогических наук В.И. Шапошникова.
Начиная с 1953 года, основными направлениями исследований сотрудников ЛНИИФК становится комплексное изучение аспектов тренировки взрослых и юных спортсменов и научное обоснование различных форм массовой физической культуры.
Институт в эти годы перестраивается. Вместо семнадцати мелких отделений создано несколько секторов. С октября 1954 года по март 1970 года институт возглавляет заслуженный работник культуры РСФСР, кандидат медицинских наук В.Е. Рыжкова.
Послевоенный спорт и физическая культура остро нуждались в научно-методическом обеспечении, новых научных разработках. Это хорошо понимало спортивное руководство страны.
Спортивная наука в Санкт-Петербурге имеет глубокие корни. Ее истоки следует искать в XIX веке, когда П.Ф. Лесгафтом была создана русская научная система физического образования.
В соответствии с Постановлением Президиума ЦИК СССР от 27 июля 1932 года на базе Государственного института физического образования (ГИФО) им. П.Ф. Лесгафта в январе 1933 года был создан Научный институт им. П.Ф. Лесгафта, впоследствии - Ленинградский научно-исследовательский институт физической культуры (ЛНИИФК).
Первоначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.)
