Санкт-Петербургский научный институт физической культуры был создан в январе 1933 года на базе Государственного института физического образования имени П.Ф.Лесгафта.
Изначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.).
10–12 июня 2023 г. в городе Санкт - Петербурге прошел Международный конгресс «Мануальная медицина России 2023» под эгидой Министерства здравоохранения Российской Федерации.
С 27 по 28 апреля 2023 года в г. Казани (Республика Татарстан) прошла Международная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы роли спорта в построении гражданского общества и народной дипломатии» (с участием представителей государств-участников Содружества Независимых Государств, БРИКС), посвященная 100-летию образования государственного органа управления в сфере физической культуры и спорта.
28 мая 2021 года в режиме онлайн конференции прошел международный круглый стол «Программа ВОЗ Health Behaviour in School-Aged Children (HBSC) – Поведение детей школьного возраста в отношении здоровья».
С 29 марта по 05 апреля в ФГБУ СПбНИИФК прошли курсы повышения квалификации по дополнительной профессиональной образовательной программе «Организация и проведение физкультурно-оздоровительных занятий с различными социальными группами населения по месту жительства».
18 мая 2020 года в формате онлайн-конференции состоялось мероприятие международного проекта «Поведение детей школьного возраста в отношении здоровья» (Health Behaviour in School-aged Children (HBSC)), посвященное обсуждению по теме «Результаты исследования HBSC. Российские показатели и их сравнение с другими странами Европейского региона ВОЗ».
С 26.10.2019 по 05.11.2019 в рамках сотрудничества со спортивными секциями по рукопашному бою ГБОУ СОШ №495 Московского района и ГБОУ СОШ №314 Фрунзенского района, сотрудники лаборатории психологии и психофизиологии спорта ФГБУ СПбНИИФК провели текущее обследование юных спортсменов.
С 26.10.2019 по 05.11.2019 в рамках сотрудничества со спортивными секциями по рукопашному бою ГБОУ СОШ №495 Московского района и ГБОУ СОШ №314 Фрунзенского района, сотрудники лаборатории психологии и психофизиологии спорта ФГБУ СПбНИИФК провели текущее обследование юных спортсменов.
Научный сотрудник ФГБУ СПбНИИФК Анна Игоревна Маточкина приняла участие в Семинаре для центров передового опыта и экспертов в Российской Федерации по профилактике и борьбе с неинфекционными заболеваниями (НИЗ), организованном Европейским офисом ВОЗ по профилактике НИЗ и борьбе с ними и Министерством здравоохранения Российской Федерации.
Научный сотрудник ФГБУ СПбНИИФК Анна Игоревна Маточкина приняла участие в ежегодной весенней встрече участников международного проекта «Поведение детей школьного возраста в отношении здоровья» (Health Behaviour in School-aged Children (HBSC)), проходившей с 18 по 20 июня 2019 года в Рейкьявике, Исландия.
28 мая 2018 года отметил 85-летний юбилей ровесник института, старейший сотрудник СПбНИИФК, проработавший в институте 30 лет, заведующий сектором физической реабилитации и оздоровительных технологий (ФРиОТ), кандидат педагогических наук, доцент Дмитрий Николаевич Гаврилов.
В соответствии с Постановлением Президиума ЦИК СССР от 27 июля 1932 года на базе Государственного института физического образования (ГИФО) им. П.Ф. Лесгафта в январе 1933 года был создан Научный институт им. П.Ф. Лесгафта, впоследствии - Ленинградский научно-исследовательский институт физической культуры (ЛНИИФК).
Первоначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.)
